123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0352 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  357  6e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  64.16 
 
 		 189 aa  208  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  59.75 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  48.82 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  48.34 
 
 		 223 aa  174  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  47.69 
 
 		 216 aa  167  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  46.45 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  42.08 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  47.06 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  43.9 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  42.93 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  41.27 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  44.16 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  41.75 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  40.86 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  41.3 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  42.29 
 
 		 208 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  40.8 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  40.3 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  37.44 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  34.34 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  36.46 
 
 		 218 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  34.85 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  38.38 
 
 		 222 aa  92.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  36 
 
 		 223 aa  92.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  36.81 
 
 		 219 aa  92  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  36.81 
 
 		 217 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  36.81 
 
 		 217 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  36.81 
 
 		 217 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  38.38 
 
 		 222 aa  90.9  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  34.34 
 
 		 219 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  35.61 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  37.63 
 
 		 224 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  33.5 
 
 		 245 aa  89  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  31.47 
 
 		 225 aa  89  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  34.02 
 
 		 221 aa  88.6  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  33.5 
 
 		 224 aa  88.2  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  30.96 
 
 		 225 aa  88.2  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  32.99 
 
 		 219 aa  87.8  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  33.5 
 
 		 219 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  33.51 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  35.05 
 
 		 226 aa  85.9  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  34.41 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  34.76 
 
 		 225 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  35.33 
 
 		 222 aa  85.5  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  34.2 
 
 		 219 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  34.2 
 
 		 219 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  34.2 
 
 		 219 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  34.02 
 
 		 219 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  33.69 
 
 		 227 aa  85.1  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  84.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  35.33 
 
 		 246 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  34.24 
 
 		 221 aa  84.3  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  35.33 
 
 		 221 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  35.33 
 
 		 221 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  36.63 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  33.99 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  36.63 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  36.63 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  35.33 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  35.33 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  33.7 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  31.65 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  33.7 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  33.7 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  33.69 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  33.7 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  33.7 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  33.7 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  33.7 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  33.7 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  33.7 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  34.88 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  29.55 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  29.13 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  29.13 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  26.56 
 
 		 230 aa  52.4  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  25.37 
 
 		 234 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  24.39 
 
 		 228 aa  51.2  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  26.15 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  23.66 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  23.66 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  28.93 
 
 		 236 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  28 
 
 		 262 aa  48.9  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  27.69 
 
 		 258 aa  48.5  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  27.34 
 
 		 266 aa  47.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  23.64 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  24.18 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1456  hypothetical protein  30.4 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  26.02 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  30.65 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  28.87 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  28.38 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  22.22 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  22.22 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1061  hypothetical protein  30.4 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  28.87 
 
 		 263 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1276  hypothetical protein  30.95 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0147934  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  28.46 
 
 		 234 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>