118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1418 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  362  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  64.16 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  59.88 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  45.03 
 
 		 216 aa  150  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  45.03 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  44.5 
 
 		 223 aa  148  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  46.43 
 
 		 207 aa  140  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  41.33 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  45.05 
 
 		 210 aa  138  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  44.15 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  44.15 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  47.7 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  43.32 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  42.7 
 
 		 204 aa  134  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  45.05 
 
 		 212 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  38.81 
 
 		 220 aa  127  9.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  42.71 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  42.21 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  41.71 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  35.79 
 
 		 245 aa  97.8  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  34.74 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  38.5 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  37.71 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  36.57 
 
 		 223 aa  92.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  37.85 
 
 		 246 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  36.72 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  35.43 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  37.85 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  37.85 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  36.51 
 
 		 217 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  36.72 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  36.72 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  36.72 
 
 		 222 aa  87.8  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  32.76 
 
 		 222 aa  87  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  35.03 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  37.29 
 
 		 221 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  37.29 
 
 		 221 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  34.29 
 
 		 219 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  34.29 
 
 		 219 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  34.29 
 
 		 219 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  34.29 
 
 		 219 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  36.16 
 
 		 221 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  84.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  38.29 
 
 		 224 aa  84.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  36.17 
 
 		 216 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  36.72 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  35.03 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  35.23 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  31.43 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  32.12 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  32.57 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  32.62 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  36.27 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  35.75 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  32 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  34.46 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  31.05 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  32 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  32 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  32 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  32 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  34.46 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  31.58 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  32.48 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  31.76 
 
 		 225 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  29.41 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  29.23 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  29.82 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  28.48 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  29.29 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  26.75 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  26.14 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  28.23 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  28.23 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  26.62 
 
 		 266 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  26.24 
 
 		 230 aa  51.2  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  26.47 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  29.77 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  31.68 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  29.34 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  25.95 
 
 		 234 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  25.95 
 
 		 234 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  23.78 
 
 		 233 aa  48.5  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  27.56 
 
 		 252 aa  48.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  27.56 
 
 		 252 aa  48.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1276  hypothetical protein  29.93 
 
 		 172 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0147934  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  24.1 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1328  hypothetical protein  25.2 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  28.06 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  29.6 
 
 		 236 aa  45.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  24.82 
 
 		 262 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  20.39 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  24.19 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>