103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0305 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  96.88 
 
 
225 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  50.75 
 
 
225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  46.8 
 
 
222 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  51.74 
 
 
223 aa  194  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  49.25 
 
 
225 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  51.03 
 
 
222 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  51.03 
 
 
222 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  51.03 
 
 
222 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  51.3 
 
 
223 aa  191  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  52.58 
 
 
222 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  50.52 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  46.88 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  47.62 
 
 
219 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  45.5 
 
 
217 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  45.5 
 
 
217 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  45.5 
 
 
217 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  45.89 
 
 
219 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  45.16 
 
 
219 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  45.5 
 
 
219 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  47.62 
 
 
219 aa  185  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  44.97 
 
 
219 aa  185  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  45.5 
 
 
219 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  45.5 
 
 
219 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  45.5 
 
 
219 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  45.29 
 
 
245 aa  184  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  45.5 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  49.74 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  46.77 
 
 
221 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  46.77 
 
 
221 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  46.77 
 
 
221 aa  182  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  46.77 
 
 
221 aa  182  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  46.77 
 
 
221 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  46.77 
 
 
221 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  44.97 
 
 
226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  46.77 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  46.77 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  44.97 
 
 
221 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  47.76 
 
 
221 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  47.76 
 
 
221 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  44.59 
 
 
246 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  44.81 
 
 
221 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  44.62 
 
 
219 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  47.76 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  47.76 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  46.27 
 
 
221 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  47.69 
 
 
221 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  47.28 
 
 
216 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  47.31 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  45.73 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  47.28 
 
 
218 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  44.32 
 
 
222 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  44.32 
 
 
222 aa  168  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  46.2 
 
 
217 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  36.27 
 
 
208 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  98.6  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  34.12 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  32.51 
 
 
216 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  33.51 
 
 
207 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  32.02 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  36.47 
 
 
181 aa  89.4  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  32.02 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  37.93 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  41.13 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  31.05 
 
 
204 aa  88.6  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  31.19 
 
 
210 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  30.96 
 
 
186 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  40.43 
 
 
208 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  40.43 
 
 
208 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  30.59 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  31.05 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  29.67 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  29.41 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  28.86 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  28.08 
 
 
185 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  26.32 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  23.47 
 
 
233 aa  52.8  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  26.53 
 
 
235 aa  52  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  26.71 
 
 
234 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  26.71 
 
 
234 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  28.29 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  26.32 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  24.41 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  29.23 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  29.05 
 
 
212 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  29.05 
 
 
212 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  26.03 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  24.83 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  27.78 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  26.7 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  26.28 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  27.45 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  23.61 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  27.69 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  28.95 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  32.54 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  24.32 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  25.66 
 
 
263 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  27.69 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>