130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2665 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  81.19 
 
 		 207 aa  313  9e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  74.75 
 
 		 208 aa  289  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  75 
 
 		 208 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  73.53 
 
 		 208 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  73.04 
 
 		 208 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  63.68 
 
 		 204 aa  228  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  48.51 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  46.53 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  46.04 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  45.91 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  40.69 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  49.75 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  42.93 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  42 
 
 		 186 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  44.95 
 
 		 181 aa  138  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  45.66 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  44.75 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  47.32 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  34.07 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  38.46 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  35.43 
 
 		 223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  37.95 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  35.58 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  37.63 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  41.78 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  35.91 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  35.91 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  32.41 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  32.41 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  32.41 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  31.94 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  31.94 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  34.3 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  40.52 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  40.52 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  40.52 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  40.52 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  36.15 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  41.38 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  36.55 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  41.38 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  35.21 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  32.86 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  36.04 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  36.32 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  35.57 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  40.79 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  33.49 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  35.71 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  34.54 
 
 		 221 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  33.85 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  34.36 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  34.36 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  34.54 
 
 		 221 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  31.92 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  33.85 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  34.87 
 
 		 222 aa  95.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  34.87 
 
 		 222 aa  95.1  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  34.87 
 
 		 222 aa  95.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  33.85 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  34.45 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  34.36 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114304 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  34.02 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  34.02 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  36.41 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  34.02 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  34.02 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  34.02 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  34.02 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  43.66 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  34.18 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  32.05 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  30.48 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  30.48 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  30.77 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  32.32 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  29.88 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  31.62 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  32.59 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  27.82 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  31.25 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  33.83 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  35.29 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  36.96 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  33.59 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  30.25 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  30.47 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  28.12 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  28.12 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  28.68 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  28.76 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  29.61 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  31.11 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  33.79 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  29.92 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  28.76 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  27.85 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>