120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0027 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  74.75 
 
 
210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  71.29 
 
 
207 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  68.27 
 
 
208 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  68.75 
 
 
208 aa  255  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  68.27 
 
 
208 aa  254  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  56.8 
 
 
204 aa  221  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  45.81 
 
 
223 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  45.85 
 
 
216 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  45.32 
 
 
223 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  45.5 
 
 
208 aa  141  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  41.33 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  41.75 
 
 
186 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  44.39 
 
 
210 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  41.67 
 
 
220 aa  135  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  43.59 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  44.04 
 
 
211 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  44.04 
 
 
211 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  42.44 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  37.25 
 
 
217 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  37.11 
 
 
218 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  32.64 
 
 
225 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  34.5 
 
 
245 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  33.65 
 
 
221 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  36.27 
 
 
225 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  35.92 
 
 
227 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  36.41 
 
 
225 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  35.57 
 
 
216 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  34.5 
 
 
224 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  34.2 
 
 
222 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  32.21 
 
 
219 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  33.17 
 
 
219 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  33.17 
 
 
222 aa  98.6  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  32.06 
 
 
223 aa  98.2  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  31.61 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  33.51 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  32.55 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  33.5 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  31.96 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  31.96 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  32.64 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  31.75 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  33.01 
 
 
222 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  33.01 
 
 
222 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  31.96 
 
 
246 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  34.36 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  32.99 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  33.01 
 
 
222 aa  95.5  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  31.96 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  33.5 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  95.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  31.96 
 
 
221 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  32.47 
 
 
219 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  32.47 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  32.47 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  32.47 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  32.12 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  32.12 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  32.21 
 
 
226 aa  91.3  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  31.61 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  31.61 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  30.77 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  31.61 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  31.61 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  31.61 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  31.79 
 
 
221 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  31.61 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  30.77 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  30.77 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  30.77 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  30.93 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  34.01 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  33.17 
 
 
236 aa  85.1  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  34.09 
 
 
233 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  27.81 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  28.8 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  28.8 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  28.03 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  28.89 
 
 
185 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  30.65 
 
 
230 aa  52.4  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  26.62 
 
 
252 aa  52  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  26.62 
 
 
252 aa  52  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  31.54 
 
 
234 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  31.54 
 
 
234 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  28.67 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  30.21 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  30.22 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  28.12 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  27.21 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  28.68 
 
 
262 aa  48.5  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  27.34 
 
 
238 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  27.34 
 
 
238 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  29.73 
 
 
230 aa  48.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  30.2 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  26.47 
 
 
232 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  28.12 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  31.41 
 
 
277 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  27.69 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  30 
 
 
225 aa  45.1  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  25 
 
 
289 aa  45.1  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>