136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2724 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  531  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  66.4 
 
 
262 aa  349  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  57.36 
 
 
266 aa  301  6.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  47.45 
 
 
266 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  47.27 
 
 
256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  45.16 
 
 
261 aa  201  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  42.45 
 
 
219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  46.72 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  38.25 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  26.92 
 
 
233 aa  102  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  29.08 
 
 
231 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  26.88 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  28.76 
 
 
212 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  28.76 
 
 
212 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  27.2 
 
 
234 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  34.46 
 
 
228 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  27.86 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  28.51 
 
 
224 aa  86.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  26.45 
 
 
259 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  27.87 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  31.25 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  26.1 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  25.93 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  30.5 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  28.87 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  26.13 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  23.55 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  27.5 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  26.98 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  26.98 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  27.32 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  23.9 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  24.28 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  27.37 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  25.7 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  29.03 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  25.52 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  25.31 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  26.05 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  30.64 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  26.94 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  25.56 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  28.33 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  28.33 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  28.25 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  28.33 
 
 
208 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  23.89 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  22.67 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  22.67 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  22.67 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  28.35 
 
 
209 aa  67  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  27.34 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  23.68 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  26.8 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  22.18 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  25.81 
 
 
219 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  25.81 
 
 
219 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  27.57 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  25.81 
 
 
219 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  28.25 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  25.99 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  23.47 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  25.27 
 
 
234 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  25.27 
 
 
234 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  23.33 
 
 
208 aa  62.8  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  22.62 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  28.49 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  24.58 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  26.09 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  27.31 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  26.98 
 
 
219 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  26.98 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  26.98 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  26.98 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  25.9 
 
 
214 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  27.81 
 
 
221 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  27.81 
 
 
221 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  27.62 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  25.93 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  26.98 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  25.14 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  28.21 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  27.51 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  24.1 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  26.46 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  26.46 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  26.46 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  27.27 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  25.93 
 
 
219 aa  56.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  27.27 
 
 
221 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  27.27 
 
 
221 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  24.85 
 
 
220 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  30.61 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  30.61 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  27.27 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  25.93 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  27.81 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  27.27 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>