12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1467 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1467  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1276  hypothetical protein  92.9 
 
 		 155 aa  289  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1013  hypothetical protein  87.1 
 
 		 155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4265  hypothetical protein  81.69 
 
 		 155 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4163  hypothetical protein  83.1 
 
 		 155 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1061  hypothetical protein  81.69 
 
 		 155 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1456  hypothetical protein  80.99 
 
 		 155 aa  234  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0370  protein of unknown function DUF165  37.5 
 
 		 253 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0159  hypothetical protein  39.37 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3889  hypothetical protein  31.71 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.168768  normal  0.374571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0523  hypothetical protein  31.78 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  30.83 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>