17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0370 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0370  protein of unknown function DUF165  100 
 
 
253 aa  510  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1013  hypothetical protein  38.27 
 
 
155 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1456  hypothetical protein  41.26 
 
 
155 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1061  hypothetical protein  40.56 
 
 
155 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4265  hypothetical protein  40.56 
 
 
155 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1467  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1276  hypothetical protein  36.88 
 
 
155 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195098  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4163  hypothetical protein  39.16 
 
 
155 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.143064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0159  hypothetical protein  33.74 
 
 
184 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3889  hypothetical protein  40.52 
 
 
166 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.168768  normal  0.374571 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  32.67 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4383  protein of unknown function DUF165  35.59 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  34.41 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  34.41 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  36.59 
 
 
208 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0372  hypothetical protein  34.44 
 
 
181 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>