12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0159 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0159  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  366  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1013  hypothetical protein  37.98 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4163  hypothetical protein  37.21 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1456  hypothetical protein  34.88 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1276  hypothetical protein  37.69 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1061  hypothetical protein  34.88 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1467  hypothetical protein  39.37 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4265  hypothetical protein  34.88 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0370  protein of unknown function DUF165  33.74 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3889  hypothetical protein  33.59 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.168768  normal  0.374571 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1645  protein of unknown function DUF165  29.93 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0372  hypothetical protein  30.13 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>