35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0523 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0523  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1276  hypothetical protein  73.21 
 
 		 172 aa  248  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0147934  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0372  hypothetical protein  48.68 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  29.48 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  29.19 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0128  hypothetical protein  29.48 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  26.14 
 
 		 223 aa  51.6  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  24.16 
 
 		 225 aa  50.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3218  protein of unknown function DUF165  30.71 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164696  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  25.29 
 
 		 235 aa  48.5  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4265  hypothetical protein  37.63 
 
 		 155 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  34.62 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4163  hypothetical protein  35.48 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143064 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0189  hypothetical protein  26.14 
 
 		 475 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  27.59 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1467  hypothetical protein  31.78 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1456  hypothetical protein  36.56 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1061  hypothetical protein  36.56 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1276  hypothetical protein  31.01 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  27.21 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  37.21 
 
 		 224 aa  44.3  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4383  protein of unknown function DUF165  36.22 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  30.39 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  23.56 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  23.56 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  26.4 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  35.44 
 
 		 181 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  30.39 
 
 		 289 aa  41.6  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  31.86 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  27.13 
 
 		 223 aa  41.6  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  26.36 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  21.97 
 
 		 230 aa  40.8  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>