49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0189 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0189  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  969    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  28.82 
 
 
223 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  28.51 
 
 
228 aa  99  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  28.14 
 
 
230 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  29.05 
 
 
238 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  29.05 
 
 
238 aa  97.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  26.86 
 
 
241 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  29.07 
 
 
236 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  27.52 
 
 
242 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  27.27 
 
 
225 aa  90.1  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  26.92 
 
 
249 aa  87.8  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  28.18 
 
 
219 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  28.11 
 
 
219 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  28.97 
 
 
232 aa  84  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  25.57 
 
 
248 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  26.13 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  26.13 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  26.82 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  24.89 
 
 
285 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  24.64 
 
 
229 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  23.81 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  24.77 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  25.4 
 
 
262 aa  69.3  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  25.47 
 
 
226 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  24.53 
 
 
230 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  26.34 
 
 
236 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  25.33 
 
 
248 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  23.02 
 
 
277 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6947  hypothetical protein  25 
 
 
205 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  24.08 
 
 
298 aa  56.6  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  24.35 
 
 
289 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  23.35 
 
 
289 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  22.71 
 
 
208 aa  55.1  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  24.29 
 
 
185 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  24.14 
 
 
235 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  23.74 
 
 
226 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  19.48 
 
 
230 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  23.74 
 
 
226 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  23.74 
 
 
226 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  23.64 
 
 
254 aa  48.5  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  23.37 
 
 
208 aa  47  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  23.19 
 
 
207 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1915  hypothetical protein  22.78 
 
 
234 aa  46.2  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  25.89 
 
 
234 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  25.89 
 
 
234 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0523  hypothetical protein  26.14 
 
 
179 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.251176 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  23.45 
 
 
251 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  22.5 
 
 
228 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>