48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6947 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6947  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  33.97 
 
 
228 aa  118  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  33.01 
 
 
238 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  33.01 
 
 
238 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  29.86 
 
 
236 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  31.87 
 
 
216 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  33.81 
 
 
249 aa  99  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  29.81 
 
 
285 aa  98.6  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  33.97 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  28.37 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  33.01 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  33.02 
 
 
242 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  28.99 
 
 
241 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  34.81 
 
 
230 aa  89  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  30.58 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  29.76 
 
 
232 aa  88.6  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  30.32 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  30.68 
 
 
252 aa  85.1  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  30.68 
 
 
252 aa  85.1  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  32.97 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  27.66 
 
 
242 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  27.01 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  29.56 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  29.38 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  27.22 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  27.6 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  26.67 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0189  hypothetical protein  25 
 
 
475 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  26.34 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  23.73 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  23.73 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  27.33 
 
 
248 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  27.56 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0028  hypothetical protein  27.37 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.275505  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0060  hypothetical membrane spanning protein  27.53 
 
 
206 aa  52  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  26.59 
 
 
277 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  25.58 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  23.04 
 
 
234 aa  45.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  25.64 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  25.64 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  25.64 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1276  hypothetical protein  43.33 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0147934  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  33.06 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  23.45 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  22.28 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  22.81 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>