97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0376 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  456  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  90 
 
 
230 aa  418  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  65.14 
 
 
226 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  65.14 
 
 
226 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  65.14 
 
 
226 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  53.25 
 
 
257 aa  252  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  52.05 
 
 
229 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  47.81 
 
 
248 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  49.3 
 
 
277 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  48.09 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  42.24 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  43.53 
 
 
262 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  38.12 
 
 
216 aa  153  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  39.23 
 
 
249 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  39.51 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  34.31 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  35.48 
 
 
241 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  38.61 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  36.89 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  34.95 
 
 
242 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  34.33 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  33.17 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  40.91 
 
 
232 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  33.67 
 
 
219 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  36.54 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  35.41 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  34.45 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  34.45 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  31.58 
 
 
244 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  33.8 
 
 
236 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  30.29 
 
 
298 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  28.79 
 
 
252 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  28.79 
 
 
252 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  29.21 
 
 
242 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  32.47 
 
 
212 aa  101  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  32.47 
 
 
212 aa  101  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  28.11 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  27.59 
 
 
289 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  28.41 
 
 
289 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  31.46 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  29.03 
 
 
234 aa  89.4  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  29.13 
 
 
257 aa  89  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  29.94 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  26.51 
 
 
245 aa  85.1  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  24.35 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  27.33 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  29.15 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  28.33 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  31.25 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  31.72 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  28.93 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  24.1 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  30.52 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  29.67 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  26.25 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  31.13 
 
 
235 aa  72  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  25.82 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  31.36 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  25.56 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  26.67 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0189  hypothetical protein  25.47 
 
 
475 aa  65.1  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  23.39 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  27.33 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  25.4 
 
 
251 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  27.59 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  27.33 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  29.7 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  28.48 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  26.54 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  25.52 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  26.83 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  27.71 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  28.8 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  28.34 
 
 
241 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1328  hypothetical protein  26.9 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  24.72 
 
 
261 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  22.73 
 
 
208 aa  51.6  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  23.97 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  24.2 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  26.67 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0123  hypothetical protein  25.81 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00966496  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0128  hypothetical protein  31.25 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  28.07 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  23.35 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  28.38 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  23.21 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1893  hypothetical protein  26.45 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100448 
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  23.35 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2241  hypothetical protein  25.81 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  28.78 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1915  hypothetical protein  25.61 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6947  hypothetical protein  22.81 
 
 
205 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  25.79 
 
 
258 aa  42.4  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  25.81 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  24.03 
 
 
221 aa  42  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1212  hypothetical protein  28.83 
 
 
225 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.455556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>