87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2909 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  424  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  53.57 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  52.34 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  32.52 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  31.55 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  27.37 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  27.37 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  27.32 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  27.75 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  30.25 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  28.74 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  28.34 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  28.74 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  28.83 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  29.52 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  27.37 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  26.29 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  24.75 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  29.35 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  27.71 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  29.45 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  27.27 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1328  hypothetical protein  29.94 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  26.7 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  32.06 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  28.48 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  24.22 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  31.9 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  24.1 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  26.04 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  28.12 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  25.93 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  27.04 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  24.56 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  24.85 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  24.56 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  24.73 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  24.69 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  30.32 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  30.32 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  30.32 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  25.74 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  24.85 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  26.75 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  24.14 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  22.38 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  24.1 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  23.49 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  26.54 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  27.01 
 
 		 256 aa  52.4  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  27.07 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  26.21 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  27.44 
 
 		 285 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  25.9 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  24 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  25.14 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  27.07 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  25.16 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  25.54 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  25.62 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  27.36 
 
 		 266 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  29.25 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  23.35 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  24.07 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  21.85 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  25.91 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  25.38 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  24.84 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  24.84 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  24.84 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  27.33 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  26 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  29.89 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  22.84 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  22.84 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  23.19 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  22.56 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  28.26 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0123  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  42  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00966496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  22.56 
 
 		 221 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  22.56 
 
 		 221 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  24.83 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  24.16 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  24.16 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>