159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0021 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  472  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  50.88 
 
 
234 aa  243  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  51.61 
 
 
228 aa  234  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  49.79 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  49.09 
 
 
236 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  47.16 
 
 
235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  44.78 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  44.78 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  42.61 
 
 
234 aa  186  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  40.99 
 
 
224 aa  169  3e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  42.41 
 
 
212 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  42.41 
 
 
212 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  41.44 
 
 
185 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  34.58 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  38.16 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  38.64 
 
 
231 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  32.55 
 
 
214 aa  106  4e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  34.32 
 
 
209 aa  106  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  36.11 
 
 
257 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  34.98 
 
 
233 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  35.53 
 
 
224 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  35.68 
 
 
223 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  31.03 
 
 
236 aa  99  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  31.63 
 
 
230 aa  96.7  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  33.52 
 
 
229 aa  95.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  33.5 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  29.65 
 
 
225 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  31.58 
 
 
216 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  30.95 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  29.89 
 
 
226 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  29.89 
 
 
226 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  29.89 
 
 
226 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0052  hypothetical protein  31.43 
 
 
233 aa  85.5  7e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  33.99 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  32.84 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_002620  TC0417  hypothetical protein  29 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.230267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  30.5 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  31.75 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  30.86 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  27.62 
 
 
207 aa  79  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0310  hypothetical protein  28.64 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392294  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  31.75 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  31.25 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  29.61 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  29 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  32.34 
 
 
266 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  34.83 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0328  hypothetical protein  27.73 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373253  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1328  hypothetical protein  32.42 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  30.05 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  31.87 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  29.89 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  29.05 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  27.67 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  31.66 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  29.7 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  32.2 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  33.95 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  28.42 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  30.64 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  27.44 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  30.95 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  30.41 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  28.65 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  30.41 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  29.5 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  30.28 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  30.28 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  32.28 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  29.02 
 
 
219 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  31.21 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  28.48 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  27.46 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  29.02 
 
 
277 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  29.25 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  28 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  31.51 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  31.36 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  27.61 
 
 
289 aa  59.3  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  27.44 
 
 
249 aa  58.9  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  29.25 
 
 
217 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  29.25 
 
 
217 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  29.94 
 
 
217 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  29.25 
 
 
217 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  28.91 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  30.25 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  28.82 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  26.13 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  27.95 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  29.29 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  32.41 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  30.43 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  27.12 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>