More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0869 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0869  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  567  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0886  hypothetical protein  85.29 
 
 
118 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.401161 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0882  hypothetical protein  84.21 
 
 
116 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.631712 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0888  hypothetical protein  80.22 
 
 
94 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.436472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4138  hypothetical protein  28.96 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.282572  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6639  hypothetical protein  30.22 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0141864  hitchhiker  0.00000000130363 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  29.82 
 
 
727 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2104  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.6 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0282857  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.38 
 
 
731 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  30.38 
 
 
731 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2180  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.53 
 
 
434 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037099  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1841  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.53 
 
 
448 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2412  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.53 
 
 
448 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4539  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.17 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0626  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.23 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000304657  hitchhiker  0.00000002328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01366  hypothetical maturase  27.44 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.702192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0955  group II intron, maturase  27.64 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2471  group II intron, maturase  27.64 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.546508  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2387  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.18 
 
 
337 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0908163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1723  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.58 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1292  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.05 
 
 
434 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  29.59 
 
 
488 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1186  hypothetical protein  43.18 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.115619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  27.11 
 
 
483 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2112  RNA-directed DNA polymerase  24.14 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0416  RNA-directed DNA polymerase  24.14 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1076  RNA-directed DNA polymerase  24.14 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1245  RNA-directed DNA polymerase  24.14 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0156  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.51 
 
 
470 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0963  RNA-directed DNA polymerase  24.14 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0470152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4151  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1508  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1471  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000733074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3919  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1498  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2924  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2051  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1223  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  25.84 
 
 
492 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0167  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.12 
 
 
470 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02784  hypothetical maturase  26.83 
 
 
423 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0934  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.6 
 
 
418 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.63429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0487  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.12 
 
 
470 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0265658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1227  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.61 
 
 
342 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.01115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2027  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.12 
 
 
470 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4396  hypothetical protein  25.3 
 
 
434 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1189  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.55 
 
 
605 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0255712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3148  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.45 
 
 
315 aa  63.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.444355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0749  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.74 
 
 
470 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1035  hypothetical protein  23.68 
 
 
288 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.921224  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  28.71 
 
 
503 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0829  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.35 
 
 
470 aa  62.4  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.880768  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  27.5 
 
 
503 aa  62.4  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2224  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.35 
 
 
470 aa  62.4  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.321211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00420  hypothetical maturase  27.44 
 
 
334 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02621  hypothetical maturase  27.44 
 
 
334 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2269  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  28.65 
 
 
446 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.295773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00457  hypothetical maturase  27.44 
 
 
423 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3013  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.42 
 
 
444 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301733  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  31.13 
 
 
439 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  26.17 
 
 
576 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  26.17 
 
 
576 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  26.17 
 
 
576 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  26.17 
 
 
592 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  28.39 
 
 
515 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1986  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.2 
 
 
433 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.289767  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00703  probable reverse transcriptase/maturase family protein  37.11 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0622  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.24 
 
 
603 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000352823  hitchhiker  0.00000108768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2677  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.48 
 
 
447 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1070  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.24 
 
 
603 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.229974  normal  0.255999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4019  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.94 
 
 
415 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3172  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.17 
 
 
466 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  29.05 
 
 
495 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  23.78 
 
 
556 aa  60.1  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3163  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.87 
 
 
420 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1201  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.87 
 
 
420 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  28.98 
 
 
635 aa  59.3  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  28.98 
 
 
635 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1421  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.87 
 
 
420 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1481  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.62 
 
 
418 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.251743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2212  RNA-directed DNA polymerase  32.19 
 
 
454 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0905944  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2085  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.87 
 
 
420 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1035  hypothetical protein  27.93 
 
 
482 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1253  hypothetical protein  27.93 
 
 
482 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1977  hypothetical protein  27.93 
 
 
482 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  28.07 
 
 
587 aa  58.9  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.49 
 
 
596 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  29.93 
 
 
495 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1212  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.16 
 
 
455 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.835307  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1349  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.76 
 
 
457 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000323944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.9 
 
 
437 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  25.57 
 
 
549 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1820  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.41 
 
 
434 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.70829 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0629  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.4 
 
 
411 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5840  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.08 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0383  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.1 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0483  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  21.66 
 
 
419 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  26.67 
 
 
515 aa  57.4  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4498  RNA-directed DNA polymerase  27.36 
 
 
504 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  29.94 
 
 
634 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>