266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2982 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2982  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 
74 aa  138  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.458364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5183  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  50 
 
 
71 aa  69.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3947  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  45.83 
 
 
73 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8317  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.59 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  44.29 
 
 
1203 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4093  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.79 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.607208  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7733  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.27 
 
 
71 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2917  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  49.28 
 
 
70 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.332862  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3702  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  42.65 
 
 
70 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  47.69 
 
 
1206 aa  60.5  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1259  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase beta subunit  45.59 
 
 
603 aa  60.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.911837  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3712  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.79 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1576  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.12 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  40.58 
 
 
1200 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3099  biotin/lipoyl attachment  40.85 
 
 
73 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10099  normal  0.0574467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1410  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.15 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.501962  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  40.58 
 
 
1201 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  46.88 
 
 
567 aa  57  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  39.71 
 
 
1231 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  40.91 
 
 
1226 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  35.29 
 
 
1212 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  41.79 
 
 
1204 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2550  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.31 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.163207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2371  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.31 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0520447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2329  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.31 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.258491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2287  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.31 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.31 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2562  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.31 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57064e-19 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  39.71 
 
 
1172 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2513  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.31 
 
 
71 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2810  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.31 
 
 
71 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000978234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  37.31 
 
 
1203 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2605  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.31 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2357  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.31 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3861  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.18 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0549  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.18 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  37.88 
 
 
1209 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  37.31 
 
 
721 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  40.62 
 
 
613 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  33.82 
 
 
1212 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  36.23 
 
 
1208 aa  54.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  40.3 
 
 
1210 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  40.3 
 
 
1204 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  37.88 
 
 
1228 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1839  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.31 
 
 
70 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.473895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3765  biotin/lipoyl attachment  39.71 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.10009  normal  0.309816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  39.71 
 
 
1183 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1804  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  42.65 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0211205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0965  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.24 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279556  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  39.39 
 
 
1488 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2442  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  42.19 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  37.31 
 
 
1201 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0859  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  37.88 
 
 
650 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00177232  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1643  pyruvate carboxylase subunit B  35.82 
 
 
582 aa  51.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667683  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0808  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  45 
 
 
611 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.443377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  38.81 
 
 
577 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4108  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.81 
 
 
72 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.888479  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1620  biotin/lipoyl attachment  41.18 
 
 
609 aa  50.4  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  40.3 
 
 
690 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  37.31 
 
 
1176 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1784  pyruvate carboxylase subunit B  32.84 
 
 
582 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.803588  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1941  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  34.33 
 
 
686 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  37.31 
 
 
1176 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0916  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.88 
 
 
610 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  39.34 
 
 
604 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  40.32 
 
 
596 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  36.51 
 
 
1200 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  41.79 
 
 
690 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1200  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.24 
 
 
609 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  41.94 
 
 
1033 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0881  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  37.68 
 
 
599 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178794  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1267  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  41.18 
 
 
615 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0940  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  37.68 
 
 
599 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1381  putative acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  34.33 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1415  putative acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  34.33 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.979594  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1399  putative acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  34.33 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.46478  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1011  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  36.23 
 
 
599 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  38.71 
 
 
599 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4187  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.24 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1508  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2  41.94 
 
 
600 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3259  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  41.18 
 
 
659 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  35.82 
 
 
1179 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90975  Pyruvate carboxylase  44.83 
 
 
1179 aa  47.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.301663  normal  0.518395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3309  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.5 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.837513  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  33.82 
 
 
604 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  35.82 
 
 
577 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1063  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.58 
 
 
676 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1095  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  45.31 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  40.32 
 
 
599 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0319  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  42.86 
 
 
131 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3800  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.81 
 
 
70 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0529751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3884  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.81 
 
 
70 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3743  biotin/lipoyl attachment protein  38.81 
 
 
70 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.325325  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  41.54 
 
 
568 aa  47  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1376  Oxaloacetate decarboxylase  32.89 
 
 
676 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.132015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  37.5 
 
 
1233 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3023  biotin/lipoyl attachment  38.71 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0964  biotin/lipoyl attachment  40.32 
 
 
602 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0659271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0461  hypothetical protein  33.82 
 
 
661 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00676863  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  38.1 
 
 
602 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>