More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3309 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3309  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 
131 aa  249  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.837513  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0203  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  49.24 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0192452  normal  0.752214 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0799  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  39.69 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0997  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  39.86 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1757  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.15 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1365  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.64 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0208474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1819  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.77 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4719  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  39.66 
 
 
667 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1491  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.75 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157118 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  32.87 
 
 
616 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0049  biotin/lipoyl attachment  40.91 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0152138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  46.07 
 
 
599 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1032  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  44.16 
 
 
646 aa  65.5  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.485137  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0916  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.28 
 
 
610 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0583  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.54 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5970  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50 
 
 
672 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1250  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.15 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1609  methylmalonyl-CoA decarboxylase, gamma subunit  37.5 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3693  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.87 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0148  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.2 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00853236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4157  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  49.28 
 
 
663 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825758  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0475  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.53 
 
 
670 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0700  biotin/lipoyl attachment protein  34.85 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3023  biotin/lipoyl attachment  31.88 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  35.71 
 
 
596 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0631  pyruvate carboxylase subunit B  43.42 
 
 
619 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3759  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  45.95 
 
 
672 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.746239 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3040  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.95 
 
 
672 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.233889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1591  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.85 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000447917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1737  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.21 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0847  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.95 
 
 
730 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3830  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  38.68 
 
 
674 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2064  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.06 
 
 
700 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0212  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  30.77 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0531  pyruvate carboxylase subunit B  47.14 
 
 
596 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11353  biotin carboxyl carrier protein  42.65 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0269  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  30.89 
 
 
169 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  47.14 
 
 
596 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2116  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  41.25 
 
 
692 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278717 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1171  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  44.44 
 
 
646 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2509  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  44.44 
 
 
646 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  40.54 
 
 
1147 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0342  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.06 
 
 
704 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1620  biotin/lipoyl attachment  34.13 
 
 
609 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0311  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  47.06 
 
 
706 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2010  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  44.44 
 
 
646 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1941  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  49.23 
 
 
686 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0293  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.84 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  34.4 
 
 
604 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0210  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  30.43 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  27.69 
 
 
613 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1682  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  40.26 
 
 
1097 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  33.33 
 
 
604 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  30.66 
 
 
633 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4233  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  41.12 
 
 
594 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.213527  normal  0.607428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2435  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00647679  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4393  pyruvate carboxylase  42.67 
 
 
645 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318019  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  43.48 
 
 
590 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4307  pyruvate carboxylase  42.67 
 
 
645 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3151  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.44 
 
 
657 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4687  pyruvate carboxylase  42.67 
 
 
645 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2163  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  40.96 
 
 
623 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0578924  normal  0.656979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  43.28 
 
 
610 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2736  biotin carboxylase/biotin-containing subunit  41.89 
 
 
649 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2457  pyruvate carboxylase  50 
 
 
1127 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000300234 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1343  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  27.2 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1957  pyruvate carboxylase  44.59 
 
 
1148 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1435  pyruvate carboxylase subunit B  31.78 
 
 
638 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897989  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2669  pyruvate carboxylase  35.59 
 
 
1164 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2425  pyruvate carboxylase subunit B  33.6 
 
 
571 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  38.58 
 
 
595 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1533  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  43.04 
 
 
612 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.385954  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4351  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  45.95 
 
 
677 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  41.18 
 
 
690 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_002936  DET0119  pyruvate carboxylase subunit B  38.39 
 
 
584 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.698581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  34.92 
 
 
603 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  42.39 
 
 
590 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1200  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.27 
 
 
609 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  42.39 
 
 
590 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2549  pyruvate carboxylase  43.06 
 
 
1149 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.011252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0808  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.76 
 
 
611 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.443377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0519  pyruvate carboxylase  43.28 
 
 
1144 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  41.18 
 
 
690 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  44.12 
 
 
604 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0859  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  46.97 
 
 
650 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00177232  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1568  Oxaloacetate decarboxylase  36.36 
 
 
641 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00759156  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2415  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  39.19 
 
 
675 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0170966  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1586  pyruvate carboxylase subunit B  28.91 
 
 
573 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.526056  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0952  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  32.45 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16520  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  41.54 
 
 
666 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0738  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  38.75 
 
 
645 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.623779  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4792  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  39.39 
 
 
1098 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5538  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  43.94 
 
 
596 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0551401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  43.66 
 
 
597 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  40.54 
 
 
1157 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1267  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  44.78 
 
 
615 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  40.7 
 
 
605 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2165  pyruvate carboxylase  38.46 
 
 
1145 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1855  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  41.33 
 
 
666 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181486  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  36.72 
 
 
606 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>