More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0916 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1508  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2  55.9 
 
 		 600 aa  671    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1620  biotin/lipoyl attachment  54.77 
 
 		 609 aa  660    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0916  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 		 610 aa  1255    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1267  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  80.13 
 
 		 615 aa  1035    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0859  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  71.93 
 
 		 650 aa  953    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00177232  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1568  Oxaloacetate decarboxylase  70.79 
 
 		 641 aa  934    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00759156  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1197  pyruvate carboxylase, subunit B  53.38 
 
 		 592 aa  639    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278458  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1200  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  84.73 
 
 		 609 aa  1052    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0940  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  55.07 
 
 		 599 aa  635    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0964  biotin/lipoyl attachment  54.99 
 
 		 602 aa  658    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0659271  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0063  Pyruvate carboxylase  53.81 
 
 		 603 aa  649    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388454  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0604  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  53.69 
 
 		 601 aa  655    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0808  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  84.15 
 
 		 611 aa  1050    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.443377  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  52.01 
 
 		 613 aa  638    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1192  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  72.39 
 
 		 634 aa  946    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1011  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  54.25 
 
 		 599 aa  630  1e-179  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0881  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  54.08 
 
 		 599 aa  630  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178794  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1259  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase beta subunit  53.15 
 
 		 603 aa  620  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.911837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  30.85 
 
 		 602 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  31.26 
 
 		 569 aa  239  9e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  31.05 
 
 		 569 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  29.35 
 
 		 605 aa  237  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  30.77 
 
 		 569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  30.73 
 
 		 567 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  29.9 
 
 		 590 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  29.9 
 
 		 590 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  29.9 
 
 		 590 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  29.84 
 
 		 568 aa  233  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  29.64 
 
 		 599 aa  233  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  30.19 
 
 		 602 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  29.15 
 
 		 599 aa  233  8.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  29.9 
 
 		 589 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5124  pyruvate carboxylase subunit B  29.25 
 
 		 602 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  29.59 
 
 		 607 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5346  pyruvate carboxylase subunit B  29.07 
 
 		 602 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5255  pyruvate carboxylase subunit B  29.07 
 
 		 602 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.594563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5395  pyruvate carboxylase subunit B  29.25 
 
 		 602 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  29.43 
 
 		 607 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  29.59 
 
 		 589 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5510  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  29.29 
 
 		 602 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  29.79 
 
 		 589 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  29.18 
 
 		 589 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  29.34 
 
 		 602 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_128  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  31.54 
 
 		 587 aa  224  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  30.74 
 
 		 594 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0119  pyruvate carboxylase subunit B  30.76 
 
 		 584 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.698581  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  27.92 
 
 		 633 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  29.51 
 
 		 589 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1784  pyruvate carboxylase subunit B  29.53 
 
 		 582 aa  220  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  29.46 
 
 		 591 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  28.86 
 
 		 602 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1586  pyruvate carboxylase subunit B  30.93 
 
 		 573 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.526056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  29.33 
 
 		 617 aa  219  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  29.74 
 
 		 567 aa  219  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  29.74 
 
 		 591 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  29.23 
 
 		 588 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0250  pyruvate carboxylase subunit B  30.45 
 
 		 582 aa  216  8e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  28.14 
 
 		 604 aa  216  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  29.17 
 
 		 599 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  27.73 
 
 		 616 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  28.12 
 
 		 609 aa  212  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0531  pyruvate carboxylase subunit B  27.22 
 
 		 596 aa  210  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2425  pyruvate carboxylase subunit B  30.07 
 
 		 571 aa  210  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1010  pyruvate carboxylase subunit B  28.5 
 
 		 579 aa  210  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  27.22 
 
 		 596 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  27.43 
 
 		 615 aa  209  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1435  pyruvate carboxylase subunit B  28.7 
 
 		 638 aa  208  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0693  oxaloacetate decarboxylase  29.15 
 
 		 602 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0819  oxaloacetate decarboxylase  31.3 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  28.75 
 
 		 595 aa  208  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  28.94 
 
 		 591 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0796  oxaloacetate decarboxylase  31.3 
 
 		 462 aa  207  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  27.95 
 
 		 597 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0631  pyruvate carboxylase subunit B  26.43 
 
 		 619 aa  204  4e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  28.62 
 
 		 577 aa  203  7e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  27.88 
 
 		 604 aa  200  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  27.39 
 
 		 577 aa  200  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  29.05 
 
 		 604 aa  200  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0894  oxaloacetate decarboxylase  29.06 
 
 		 589 aa  200  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2034  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  29.58 
 
 		 507 aa  200  7.999999999999999e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00118828  decreased coverage  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0971  oxaloacetate decarboxylase  27.71 
 
 		 595 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195309  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1643  pyruvate carboxylase subunit B  27.67 
 
 		 582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  27.9 
 
 		 594 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  27.87 
 
 		 604 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0461  hypothetical protein  28.44 
 
 		 661 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00676863  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  26.98 
 
 		 601 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  28.07 
 
 		 603 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  29.03 
 
 		 598 aa  193  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0075  hypothetical protein  27.16 
 
 		 681 aa  193  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  28.46 
 
 		 607 aa  193  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  27.84 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  28.16 
 
 		 592 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  28.5 
 
 		 606 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  28.73 
 
 		 608 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  26.86 
 
 		 602 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  27.67 
 
 		 611 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  27.97 
 
 		 611 aa  190  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  27.03 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1606  oxaloacetate decarboxylase alpha subunit  27.44 
 
 		 608 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0818232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  26.98 
 
 		 599 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>