94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0614 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0614  glycine betaine transporter periplasmic subunit  100 
 
 		 335 aa  691    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003611  L-proline glycine betaine binding ABC transporter protein proX/osmotic adaptation  74.6 
 
 		 312 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3736  glycine betaine transporter periplasmic subunit  66.36 
 
 		 333 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1059  glycine betaine transporter periplasmic subunit  67.49 
 
 		 334 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3534  glycine betaine transporter periplasmic subunit  67.08 
 
 		 326 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0200308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1113  glycine betaine transporter periplasmic subunit  66.87 
 
 		 334 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3478  glycine betaine transporter periplasmic subunit  65.15 
 
 		 335 aa  454  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.688917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3322  glycine betaine transporter periplasmic subunit  63.96 
 
 		 335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0863  glycine betaine transporter periplasmic subunit  62.42 
 
 		 332 aa  448  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3159  glycine betaine transporter periplasmic subunit  62.73 
 
 		 331 aa  447  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.138504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2994  glycine betaine transporter periplasmic subunit  62.73 
 
 		 331 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  hitchhiker  0.00724532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2959  glycine betaine transporter periplasmic subunit  62.42 
 
 		 331 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0307934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2928  glycine betaine transporter periplasmic subunit  62.42 
 
 		 331 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2960  glycine betaine transporter periplasmic subunit  63.33 
 
 		 330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2801  glycine betaine transporter periplasmic subunit  63.33 
 
 		 330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0222237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3200  glycine betaine transporter periplasmic subunit  63.33 
 
 		 330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3011  glycine betaine transporter periplasmic subunit  62.12 
 
 		 331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3117  glycine betaine transporter periplasmic subunit  62.42 
 
 		 331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.293613 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2815  glycine betaine transporter periplasmic subunit  63.03 
 
 		 330 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02535  glycine betaine transporter subunit  63.03 
 
 		 330 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1004  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  63.03 
 
 		 330 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1027  glycine betaine transporter periplasmic subunit  63.03 
 
 		 330 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02499  hypothetical protein  63.03 
 
 		 330 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3923  glycine betaine transporter periplasmic subunit  63.03 
 
 		 330 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.334646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0895  glycine betaine transporter periplasmic subunit  62.46 
 
 		 331 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2666  glycine betaine transporter periplasmic subunit  65.69 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00589435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1495  glycine betaine transporter periplasmic subunit  64.29 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0772797  normal  0.339425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3735  glycine betaine transporter periplasmic subunit  60.99 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0979  glycine betaine transporter periplasmic subunit  62.87 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.84837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2477  glycine betaine transporter periplasmic subunit  60.97 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2519  glycine betaine transporter periplasmic subunit  56.97 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1061  glycine betaine transporter periplasmic subunit  62.63 
 
 		 283 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.258222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3998  glycine betaine transporter periplasmic subunit  52.92 
 
 		 328 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2691  glycine betaine transporter periplasmic subunit  48.69 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208597  normal  0.538779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3058  glycine betaine ABC transporter, periplasmic glycine betaine-binding protein  46.44 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302341  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6146  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  47.74 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.485636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1458  glycine betaine transporter periplasmic subunit  43.75 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4110  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  44.44 
 
 		 662 aa  293  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1459  glycine betaine transporter periplasmic subunit  42.86 
 
 		 336 aa  293  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0408344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1820  glycine betaine transporter periplasmic subunit  39.6 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2299  glycine betaine transporter periplasmic subunit  40.06 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2312  glycine betaine transporter periplasmic subunit  39.47 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0202463  hitchhiker  0.00638475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2074  glycine betaine transporter periplasmic subunit  39.47 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699526  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1819  glycine betaine transporter periplasmic subunit  38.89 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.350486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2026  glycine betaine transporter periplasmic subunit  39.46 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.259484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2531  glycine betaine transporter periplasmic subunit  36.56 
 
 		 342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694403  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4317  glycine betaine transporter periplasmic subunit  37.3 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134242  normal  0.156439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4313  glycine betaine transporter periplasmic subunit  34.43 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.290364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2295  glycine betaine transporter periplasmic subunit  35.85 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.144012  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0537  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.74 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1438  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.55 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0879571  normal  0.595095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2583  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.4 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67300  putative binding protein component of ABC transporter  27.11 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0235  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.17 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00289978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2780  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.94 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4837  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.1 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180074  normal  0.0229779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2775  glycine betaine/L-proline ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  29.19 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5836  hypothetical protein  24.68 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67400  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.21 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3319  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.3 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26190  ABC-type proline/glycine betaine transport system, periplasmic component  20.85 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000363  L-proline glycine betaine binding ABC transporter protein proX  24.91 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.743651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3514  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.15 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5281  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.02 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.190952 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5760  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.4 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2308  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.3 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00541806  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1285  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.97 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.435568  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6868  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  19.88 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0362  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.82 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.376501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2543  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.51 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.221502  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0958  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.24 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00282078  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1086  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.05 
 
 		 646 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.809733  normal  0.592465 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0822  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.89 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4829  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.47 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.93299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3733  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.81 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.409518 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1472  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.14 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.338312  hitchhiker  0.00631972 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1901  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.32 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135733  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0675  glycine/betaine/L-proline ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.36 
 
 		 279 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000223596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0028  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.05 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5271  histidine transporter, periplasmic histidine-binding protein  23.13 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0166  glycine/betaine family, ABC transporter, substrate-binding protein  20.73 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4028  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.81 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.662148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2490  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.34 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4749  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  20.28 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.628354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0031  hypothetical protein  21.63 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0734  response regulator receiver protein  24.72 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.909833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0092  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.05 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7255  ABC transporter substrate binding protein (glycine-betaine)  22.58 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.999285  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2285  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.93 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.185134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2582  twin-arginine translocation pathway signal  18.62 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.887396  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0671  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  20.85 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0076  glycine betaine-binding protein, putative  20.97 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000390865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3406  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.3 
 
 		 278 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2583  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  20.56 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0350261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>