82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2155 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2155  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0023  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  69.54 
 
 		 202 aa  303  8.000000000000001e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1063  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  68.69 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0027  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  68.02 
 
 		 199 aa  286  1e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1139  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.32 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00457344  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.76 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0060  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.5 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0629  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.66 
 
 		 234 aa  99.4  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0753  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.08 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2545  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.41 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2350  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.55 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1147  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.01 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0153  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  29.19 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0683456  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1680  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.05 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1966  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  30.65 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1004  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  28.79 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540991  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0183  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.17 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0290  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.59 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0073  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.24 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.690907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1624  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.78 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.904613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0028  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.38 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684856  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1418  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.67 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1474  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.21 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0131  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.92 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.45 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2761  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.82 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2594  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  26.92 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1299  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.49 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0461  orotidine 5`-phosphate decarboxylase  25 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0387  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.84 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0333  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.05 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.44706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.37 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1278  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  26.46 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0730  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.45 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000744541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0195  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.29 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1571  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.15 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0574999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2958  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.79 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0683  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.08 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0340  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.78 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0196979  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3540  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.27 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0347  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.06 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.150562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2353  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  25 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0054  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.01 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.668833  normal  0.533949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1044  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.67 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.197981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1728  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.32 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  24.55 
 
 		 513 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1288  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.97 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.536471  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0284  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  23.53 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.285229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1263  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.97 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.224772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1688  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.08 
 
 		 240 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0654719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3839  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.83 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1724  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.54 
 
 		 227 aa  45.1  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.297453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2066  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.44 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0034827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1518  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.05 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438965 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11890  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  27.23 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000215744  normal  0.0186296 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2083  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.29 
 
 		 235 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.42113  normal  0.0235739 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0810  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.42 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0110455  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1501  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.39 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199252  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0601  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.38 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0587  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.38 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0957487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.31 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1093  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.77 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.55211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2568  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.17 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000104068  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1799  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.57 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2920  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  26.96 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0029  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.14 
 
 		 244 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.02 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1757  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.94 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0566904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3908  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.79 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0684  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  27.62 
 
 		 244 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2315  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.24 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0273911  hitchhiker  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4588  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.97 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1740  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.12 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000416133  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0025  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.14 
 
 		 244 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2294  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.24 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000688308  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2077  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.24 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111408  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15250  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.14 
 
 		 231 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.955107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3960  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.89 
 
 		 234 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00328038  hitchhiker  0.000886746 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13821  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.26 
 
 		 241 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1862  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.36 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0932459  normal  0.0318257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1520  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.1 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.634391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3009  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.92 
 
 		 234 aa  41.6  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00223674  normal  0.753586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>