49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1680 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1680  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1966  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  43.26 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.24 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0629  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.65 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0060  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.42 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1139  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.49 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00457344  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1004  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  31.71 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540991  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0290  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1624  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.5 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.904613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1474  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.32 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0753  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.19 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2350  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.88 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0073  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.65 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.690907  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2545  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.25 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1147  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1063  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.58 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0028  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.9 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684856  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2155  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  31.05 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0027  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.65 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0023  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.93 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0183  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.16 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0153  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  30.43 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0683456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1418  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.27 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1688  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.61 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0654719  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1862  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.6 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0932459  normal  0.0318257 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.7 
 
 		 274 aa  45.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2119  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.1 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000535005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2353  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  25.63 
 
 		 271 aa  45.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2077  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.85 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111408  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.69 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2677  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1958  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.85 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000470134  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2275  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.7 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000296065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2392  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.7 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000113777  unclonable  0.00000908556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2315  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.07 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0273911  hitchhiker  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2070  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.7 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000195505  unclonable  0.0000000000022204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2398  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.7 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  24.83 
 
 		 280 aa  42.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2074  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.7 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000167126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2294  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.93 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000688308  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.64 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1518  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.28 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438965 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.77 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25 
 
 		 274 aa  42  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1981  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.07 
 
 		 231 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191461  unclonable  0.0000000000644794 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1928  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.07 
 
 		 231 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128014  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.07 
 
 		 231 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1757  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.18 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0566904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>