85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1966 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1966  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1680  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.26 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1147  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.81 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.98 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0629  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.86 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0753  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.63 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0060  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.68 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1139  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.48 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00457344  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2350  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.24 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0153  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  36.36 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0683456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2545  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0290  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.43 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0023  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.77 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1004  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  31.32 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540991  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1624  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.904613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0027  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.51 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0028  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.68 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684856  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1474  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.41 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1063  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.27 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0073  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.1 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.690907  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0183  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2155  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  30.65 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3540  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.84 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1299  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.27 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.95 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0254023  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0786  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.76 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1044  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.68 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.197981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2568  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.53 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000104068  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2128  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.42 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303572  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1418  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.78 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1407  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.43 
 
 		 235 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0683  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.81 
 
 		 235 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0340  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.02 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0196979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0131  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.2 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1753  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.02 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11890  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  25.89 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000215744  normal  0.0186296 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0460  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1491  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.07 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.669269 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2044  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.94 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0668079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.75 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0684  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  26.56 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3839  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.68 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0387  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.44 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4588  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.37 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.23 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1067  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.11 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.11 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.881435  normal  0.442892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.69 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4325  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.44 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07820  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 1  31.87 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0927443  normal  0.748645 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1662  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.18 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000183413  hitchhiker  0.000549225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0347  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.58 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.150562  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0461  orotidine 5`-phosphate decarboxylase  25 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1740  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.01 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000416133  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1728  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.58 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1676  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.94 
 
 		 240 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1670  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.31 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0087165  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2441  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.23 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2629  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.41 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168937 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1746  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.34 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1066  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.7 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0328253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0944  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.22 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000217759  normal  0.240259 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0284  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  25.11 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.285229  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3960  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.52 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00328038  hitchhiker  0.000886746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1688  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.35 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0654719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.56 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1571  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.18 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0574999  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1179  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1799  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.19 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4196  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.34 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1358  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.01 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.625809  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0792  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.66 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1332  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.89 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3908  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.52 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1958  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.44 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000470134  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0542  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.82 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1866  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.69 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0126  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  26.73 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000390122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0268  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.76 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2594  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  26.72 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2958  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.54 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2463  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.67 
 
 		 231 aa  42  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000296014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1278  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  25.52 
 
 		 239 aa  42  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4051  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.83 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1447  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.33 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.261218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>