218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1418 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1418  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
246 aa  503  1e-141  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0060  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.99 
 
 
221 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.99 
 
 
215 aa  105  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2350  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.88 
 
 
211 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0028  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.41 
 
 
216 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684856  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0629  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.76 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2545  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.67 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0153  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  32.16 
 
 
212 aa  89.4  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0683456  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  34.68 
 
 
513 aa  83.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0183  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.09 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.81 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.26 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.26 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.26 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.26 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.43 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.68 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.68 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.8 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.1 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1139  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.07 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00457344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.18 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.18 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.18 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.18 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.18 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.18 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.18 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.57 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0290  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.11 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1474  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.65 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1624  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.76 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.904613  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.32 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1004  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  28.64 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.09 
 
 
272 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.09 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.34 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.91 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  25.88 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.67 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.89 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.78 
 
 
274 aa  68.6  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.78 
 
 
283 aa  68.6  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.56 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.37 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.76 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.02 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.49 
 
 
282 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.76 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.89 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.25 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.79 
 
 
288 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.43 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.1 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1680  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.43 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000534867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.16 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.59 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.43 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.79 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.64 
 
 
284 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980823 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.9 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.64 
 
 
272 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2155  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  27.67 
 
 
202 aa  62  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.36 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.17 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0073  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.08 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.690907  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1147  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.27 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1063  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.7 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0027  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.11 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.11 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.19 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.67 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3742  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.19 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0768721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  28.43 
 
 
311 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2677  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.69 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0023  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.69 
 
 
202 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11414  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.37 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000186652  normal  0.109947 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  29.56 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0347031  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1320  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.48 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.382709  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.67 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  29.25 
 
 
280 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.82 
 
 
273 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.43 
 
 
274 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2077  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.31 
 
 
231 aa  55.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111408  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.97 
 
 
274 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.16 
 
 
273 aa  55.5  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.8 
 
 
314 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12700  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  24.56 
 
 
286 aa  55.1  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0173626  normal  0.0283065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2230  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.18 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  28.66 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.85 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2341  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.85 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1975  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.19 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.568621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.97 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0753  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.17 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.22 
 
 
307 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1376  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.9 
 
 
229 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.43 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>