232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0860 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0448  carbon starvation protein CstA  79.9 
 
 		 588 aa  890    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000722986  hitchhiker  0.00131941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0860  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 591 aa  1154    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.983517 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0894  carbon starvation protein CstA  90.46 
 
 		 592 aa  1016    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  30.93 
 
 		 554 aa  237  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  31.18 
 
 		 585 aa  233  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  32.51 
 
 		 537 aa  230  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  32.22 
 
 		 564 aa  213  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  30.22 
 
 		 590 aa  211  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  31.63 
 
 		 539 aa  211  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2711  carbon starvation protein CstA  34.15 
 
 		 617 aa  207  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  31.62 
 
 		 559 aa  205  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  29.78 
 
 		 555 aa  204  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  28.89 
 
 		 586 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  32 
 
 		 559 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  32.73 
 
 		 624 aa  200  7e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  28.7 
 
 		 561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  29.39 
 
 		 555 aa  197  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  31.08 
 
 		 537 aa  195  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2989  carbon starvation protein CstA  32.98 
 
 		 611 aa  193  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  29.42 
 
 		 573 aa  192  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  31.32 
 
 		 546 aa  187  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  29.93 
 
 		 585 aa  187  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  31.33 
 
 		 599 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  30.52 
 
 		 599 aa  183  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0148  carbon starvation protein CstA  28.85 
 
 		 596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  29.85 
 
 		 696 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  28.45 
 
 		 701 aa  168  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  27.76 
 
 		 703 aa  166  9e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  28.74 
 
 		 692 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  28.08 
 
 		 692 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  27.93 
 
 		 692 aa  163  7e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  33.07 
 
 		 692 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  28.72 
 
 		 692 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  32.02 
 
 		 692 aa  163  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  28.57 
 
 		 692 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  27.07 
 
 		 686 aa  163  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  28.72 
 
 		 692 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  28.72 
 
 		 692 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  28.11 
 
 		 701 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  28.11 
 
 		 701 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  28.11 
 
 		 701 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  28.11 
 
 		 701 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  28.11 
 
 		 701 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  28.57 
 
 		 692 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  31.81 
 
 		 723 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  27.7 
 
 		 686 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  27.73 
 
 		 606 aa  160  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  29.19 
 
 		 696 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  33.42 
 
 		 691 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  31.09 
 
 		 688 aa  160  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  31.09 
 
 		 688 aa  160  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  31.09 
 
 		 688 aa  160  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  27.33 
 
 		 701 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  27.33 
 
 		 701 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  32.8 
 
 		 692 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  27.33 
 
 		 701 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  27.33 
 
 		 701 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  27.33 
 
 		 701 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  32.8 
 
 		 692 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  32.8 
 
 		 692 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  27.33 
 
 		 701 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  27.14 
 
 		 688 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  26.24 
 
 		 685 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  26.24 
 
 		 685 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4945  carbon starvation family protein  32.99 
 
 		 716 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  29.13 
 
 		 615 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  32.17 
 
 		 685 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4938  carbon starvation family protein  32.99 
 
 		 716 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.457223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4785  carbon starvation family protein  32.99 
 
 		 716 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.741257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4886  carbon starvation family protein  32.99 
 
 		 716 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4859  carbon starvation family protein  32.99 
 
 		 716 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  31.93 
 
 		 691 aa  158  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  33.07 
 
 		 687 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  33.16 
 
 		 690 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2163  carbon starvation protein CstA  27.21 
 
 		 613 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4894  carbon starvation family protein  32.47 
 
 		 704 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  32.53 
 
 		 687 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04220  predicted inner membrane protein  32.2 
 
 		 716 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3643  carbon starvation protein CstA  32.47 
 
 		 716 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4946  carbon starvation family protein  32.2 
 
 		 721 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4880  carbon starvation family protein  32.2 
 
 		 721 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5866  carbon starvation family protein  32.2 
 
 		 721 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04186  hypothetical protein  32.2 
 
 		 716 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3712  carbon starvation protein CstA  32.2 
 
 		 716 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4574  carbon starvation family protein  32.2 
 
 		 721 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  30.5 
 
 		 703 aa  156  8e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  26.28 
 
 		 685 aa  157  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  27.85 
 
 		 684 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2948  carbon starvation protein CstA  27.71 
 
 		 642 aa  156  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0669407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  31.4 
 
 		 688 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  31.59 
 
 		 692 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  31.59 
 
 		 687 aa  156  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  30.5 
 
 		 703 aa  156  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  32.7 
 
 		 688 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  26.58 
 
 		 642 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0511  carbon starvation protein CstA  31.68 
 
 		 717 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2310  carbon starvation protein CstA  26.43 
 
 		 753 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265591  hitchhiker  0.00199124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3378  carbon starvation protein CstA  27.54 
 
 		 745 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  31.84 
 
 		 690 aa  154  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  32.56 
 
 		 688 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>