More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0155 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1386  AMP-dependent synthetase and ligase  76.55 
 
 		 654 aa  968    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 649 aa  1309    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.738373 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 		 638 aa  528  1e-149  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  45.17 
 
 		 667 aa  529  1e-149  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  44.86 
 
 		 666 aa  525  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  45.7 
 
 		 652 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  44.58 
 
 		 661 aa  518  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  43.44 
 
 		 636 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  43.6 
 
 		 636 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  43.86 
 
 		 664 aa  512  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  44.13 
 
 		 656 aa  514  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  45.4 
 
 		 666 aa  512  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  44.98 
 
 		 668 aa  511  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  43.13 
 
 		 636 aa  511  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  43.62 
 
 		 639 aa  511  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  45.38 
 
 		 670 aa  510  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  44.62 
 
 		 626 aa  506  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  43.46 
 
 		 639 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  43.88 
 
 		 648 aa  503  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  44.67 
 
 		 632 aa  503  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  41.8 
 
 		 652 aa  495  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  43.49 
 
 		 661 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  44.39 
 
 		 636 aa  497  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  42.26 
 
 		 667 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  42.13 
 
 		 654 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  43.53 
 
 		 661 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  42.86 
 
 		 666 aa  489  1e-137  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1386  AMP-dependent synthetase and ligase  43.1 
 
 		 626 aa  489  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.911526 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  41.48 
 
 		 652 aa  491  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  42.37 
 
 		 638 aa  488  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  43.47 
 
 		 627 aa  488  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  41.77 
 
 		 657 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  42.11 
 
 		 649 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  41.01 
 
 		 652 aa  483  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  42.11 
 
 		 631 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  41.85 
 
 		 629 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  42.97 
 
 		 633 aa  485  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  43.76 
 
 		 661 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  40.19 
 
 		 657 aa  482  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  41.47 
 
 		 631 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  41.63 
 
 		 632 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  40.03 
 
 		 656 aa  481  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  42 
 
 		 629 aa  479  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  41.89 
 
 		 656 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  41.79 
 
 		 632 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  39.47 
 
 		 664 aa  476  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  40.34 
 
 		 664 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  40.19 
 
 		 664 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  39.09 
 
 		 666 aa  477  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  41.59 
 
 		 657 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  41.19 
 
 		 650 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  39.81 
 
 		 667 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  41.86 
 
 		 660 aa  477  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  41.45 
 
 		 632 aa  475  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  39.25 
 
 		 667 aa  473  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0209  acetyl-CoA synthetase  41.8 
 
 		 650 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237661  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  40.38 
 
 		 655 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  41.72 
 
 		 644 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  40.98 
 
 		 655 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  43.33 
 
 		 670 aa  475  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  42.41 
 
 		 651 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  41.71 
 
 		 647 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  39.09 
 
 		 657 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  42.05 
 
 		 625 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  40.25 
 
 		 660 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  42.27 
 
 		 650 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  42.9 
 
 		 629 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  42.79 
 
 		 661 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  41.4 
 
 		 631 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  40.63 
 
 		 652 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  42.65 
 
 		 644 aa  467  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  40 
 
 		 655 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  40 
 
 		 655 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  41.54 
 
 		 692 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  41.24 
 
 		 649 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  38.8 
 
 		 652 aa  466  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  40.81 
 
 		 650 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  38.7 
 
 		 658 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  43.19 
 
 		 651 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  38.7 
 
 		 658 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  41.01 
 
 		 652 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  41.85 
 
 		 629 aa  462  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  39.78 
 
 		 649 aa  465  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0111  acetyl-CoA synthetase  39.72 
 
 		 646 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  39.87 
 
 		 647 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  40.5 
 
 		 654 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3974  acetyl-CoA synthetase  40.13 
 
 		 647 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162382  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2952  acetyl-CoA synthetase  41.42 
 
 		 649 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  41.79 
 
 		 660 aa  464  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  42.16 
 
 		 635 aa  465  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0420  AMP-dependent synthetase and ligase  43.79 
 
 		 629 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0761365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  39.25 
 
 		 667 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1451  acetyl-CoA synthetase  40.98 
 
 		 647 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  40.16 
 
 		 649 aa  460  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  40.06 
 
 		 649 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  41.32 
 
 		 650 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  41.42 
 
 		 651 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  41.88 
 
 		 644 aa  459  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  40.87 
 
 		 659 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  40.97 
 
 		 650 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>