More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0493 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0493  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0599096  normal  0.471382 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1345  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  78.16 
 
 
99 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.66388  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0325  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.47 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.857416  normal  0.0192993 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.56 
 
 
98 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.19 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000016572  hitchhiker  0.000000132028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.42 
 
 
402 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.42 
 
 
402 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.42 
 
 
403 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.26 
 
 
411 aa  63.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  41.56 
 
 
445 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  40.96 
 
 
433 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  41.57 
 
 
431 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  45.45 
 
 
402 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  43.06 
 
 
441 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.3 
 
 
408 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.18 
 
 
416 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  37.18 
 
 
416 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1748  iron-sulfur cluster binding protein  40.23 
 
 
399 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  39.76 
 
 
435 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  36.59 
 
 
446 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.72 
 
 
419 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.94 
 
 
471 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  35.87 
 
 
439 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.12 
 
 
452 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.81 
 
 
408 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.81 
 
 
408 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0251  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.75 
 
 
434 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  40.26 
 
 
425 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.81 
 
 
408 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  39.44 
 
 
435 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.81 
 
 
408 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.81 
 
 
408 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70670  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.94 
 
 
408 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.08 
 
 
436 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.81 
 
 
408 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  36.59 
 
 
431 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.31 
 
 
408 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
405 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.79 
 
 
417 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.31 
 
 
408 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.42 
 
 
405 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.28 
 
 
426 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.71 
 
 
439 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.96 
 
 
413 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.31 
 
 
408 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.81 
 
 
408 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  37.36 
 
 
507 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.31 
 
 
408 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.08 
 
 
410 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6130  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.42 
 
 
408 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.8 
 
 
409 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.31 
 
 
408 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.31 
 
 
408 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.35 
 
 
436 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.31 
 
 
408 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  39.02 
 
 
447 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  35.37 
 
 
434 aa  57.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.8 
 
 
413 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40 
 
 
442 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.76 
 
 
453 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  33.72 
 
 
435 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  43.28 
 
 
431 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.79 
 
 
410 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.96 
 
 
422 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.3 
 
 
410 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.79 
 
 
411 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  39.02 
 
 
446 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40 
 
 
410 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.81 
 
 
408 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.91 
 
 
423 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.79 
 
 
416 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.79 
 
 
437 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4135  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  35.16 
 
 
437 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.8 
 
 
423 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.11 
 
 
437 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.8 
 
 
465 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.65 
 
 
445 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.42 
 
 
415 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.91 
 
 
406 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  36.59 
 
 
465 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.42 
 
 
411 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.91 
 
 
406 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7456  hypothetical protein  36.59 
 
 
261 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0412051  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.42 
 
 
414 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.59 
 
 
465 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.05 
 
 
425 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.42 
 
 
418 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.62 
 
 
424 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.91 
 
 
406 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.35 
 
 
419 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.995528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.3 
 
 
415 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.88 
 
 
407 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.88 
 
 
407 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.88 
 
 
407 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  34.94 
 
 
430 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  35.53 
 
 
433 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
449 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.88 
 
 
407 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0168  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.81 
 
 
412 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520354  normal  0.880199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0186  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.81 
 
 
412 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>