More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0325 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0325  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
91 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.857416  normal  0.0192993 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0493  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.47 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0599096  normal  0.471382 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1345  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  63.95 
 
 
99 aa  124  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.66388  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  60.47 
 
 
98 aa  100  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.81 
 
 
102 aa  88.6  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000016572  hitchhiker  0.000000132028 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.97 
 
 
442 aa  67.4  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  35.29 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  44.05 
 
 
402 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.23 
 
 
419 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.08 
 
 
409 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.08 
 
 
406 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.23 
 
 
423 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.08 
 
 
406 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7456  hypothetical protein  40.23 
 
 
261 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0412051  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.35 
 
 
405 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.08 
 
 
406 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.1 
 
 
403 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.67 
 
 
411 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.08 
 
 
413 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.23 
 
 
453 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.28 
 
 
426 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.89 
 
 
408 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.89 
 
 
408 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.9 
 
 
402 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.89 
 
 
408 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.85 
 
 
405 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.78 
 
 
543 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.89 
 
 
408 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.89 
 
 
408 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.89 
 
 
408 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.89 
 
 
408 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  35.8 
 
 
474 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  34.12 
 
 
428 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  38.1 
 
 
412 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.08 
 
 
430 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.54 
 
 
408 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.05 
 
 
402 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  38.37 
 
 
426 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.47 
 
 
411 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.54 
 
 
411 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.36 
 
 
445 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  37.63 
 
 
435 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.54 
 
 
411 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.38 
 
 
408 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0901  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.9 
 
 
344 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.38 
 
 
408 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.23 
 
 
408 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.05 
 
 
407 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.05 
 
 
407 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.46 
 
 
410 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.05 
 
 
407 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.05 
 
 
407 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.05 
 
 
407 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  36.05 
 
 
407 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.29 
 
 
437 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  36.14 
 
 
431 aa  60.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.82 
 
 
413 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.05 
 
 
407 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  35 
 
 
445 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  35.87 
 
 
453 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.48 
 
 
402 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.63 
 
 
408 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.2 
 
 
408 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.91 
 
 
447 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.71 
 
 
445 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.91 
 
 
447 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.11 
 
 
408 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.6 
 
 
405 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.63 
 
 
447 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  39.29 
 
 
433 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  36.56 
 
 
416 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2919  hypothetical protein  40.66 
 
 
472 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  37.08 
 
 
388 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.08 
 
 
411 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.37 
 
 
437 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  32.95 
 
 
450 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.33 
 
 
416 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.08 
 
 
449 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  35.29 
 
 
437 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.02 
 
 
410 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.11 
 
 
408 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.71 
 
 
414 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.11 
 
 
408 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.11 
 
 
408 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.44 
 
 
453 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.71 
 
 
418 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  31.52 
 
 
446 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0492  hypothetical protein  37.97 
 
 
387 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.822723  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.71 
 
 
415 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.73 
 
 
410 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40 
 
 
410 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.71 
 
 
412 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.72 
 
 
438 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.84 
 
 
424 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.67 
 
 
419 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  35 
 
 
441 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.44 
 
 
440 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.8 
 
 
415 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  36.26 
 
 
507 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.44 
 
 
417 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>