More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1345 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1345  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
99 aa  204  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.66388  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0493  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  78.16 
 
 
97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0599096  normal  0.471382 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0325  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  63.95 
 
 
91 aa  124  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.857416  normal  0.0192993 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.33 
 
 
98 aa  101  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.75 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000016572  hitchhiker  0.000000132028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  36.26 
 
 
435 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  38.04 
 
 
441 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.83 
 
 
411 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  37.89 
 
 
445 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.03 
 
 
402 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  42.25 
 
 
435 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  40.24 
 
 
425 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  42.42 
 
 
402 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1652  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.91 
 
 
402 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0911371 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.91 
 
 
403 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.71 
 
 
408 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.16 
 
 
416 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1663  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  38.16 
 
 
416 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.44007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.22 
 
 
442 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0339  hypothetical protein  35 
 
 
460 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70670  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.88 
 
 
408 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.62 
 
 
405 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.49 
 
 
408 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.33 
 
 
452 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1748  iron-sulfur cluster binding protein  33.72 
 
 
399 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.19 
 
 
414 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.49 
 
 
408 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
408 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
419 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.49 
 
 
408 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.49 
 
 
408 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.72 
 
 
471 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.49 
 
 
408 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.49 
 
 
408 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.8 
 
 
405 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.94 
 
 
408 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.94 
 
 
408 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  36.9 
 
 
433 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.5 
 
 
413 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.89 
 
 
426 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.94 
 
 
408 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6130  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.14 
 
 
408 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.94 
 
 
408 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.94 
 
 
408 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.94 
 
 
408 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.46 
 
 
408 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.9 
 
 
419 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.995528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.94 
 
 
408 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0554  hypothetical protein  42.47 
 
 
339 aa  55.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32 
 
 
419 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
417 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.07 
 
 
453 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40 
 
 
411 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  31.65 
 
 
446 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0251  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.91 
 
 
434 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  35.71 
 
 
435 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
406 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.58 
 
 
410 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.59 
 
 
425 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40 
 
 
420 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
406 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  32.5 
 
 
431 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.62 
 
 
411 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.96 
 
 
415 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.46 
 
 
410 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.11 
 
 
447 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.18 
 
 
445 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.11 
 
 
447 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.71 
 
 
418 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0481  hypothetical protein  37.84 
 
 
421 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0193589  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
406 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.05 
 
 
453 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.38 
 
 
410 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.68 
 
 
408 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.11 
 
 
410 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
423 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.58 
 
 
418 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
414 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  30.85 
 
 
439 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.92 
 
 
409 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.56 
 
 
463 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
424 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  28.12 
 
 
421 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.21 
 
 
411 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.11 
 
 
416 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.25 
 
 
437 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.25 
 
 
431 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  26.04 
 
 
421 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  32.56 
 
 
433 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.21 
 
 
449 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0481  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.84 
 
 
422 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  38.46 
 
 
423 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.92 
 
 
413 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.55 
 
 
408 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.15 
 
 
437 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2484  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.57 
 
 
384 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668988  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.58 
 
 
415 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.21 
 
 
411 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  31.65 
 
 
431 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.85 
 
 
407 aa  52  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>