79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3864 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  100 
 
 		 244 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  76.82 
 
 		 226 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  36.6 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  36.6 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4429  Acyl-homoserine-lactone synthase  33.17 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4148  Acyl-homoserine-lactone synthase  33.17 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0067  autoinducer synthesis protein  30.73 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.719257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1716  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  30.95 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105822  hitchhiker  0.000229344 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1656  autoinducer synthesis protein  30.95 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1546  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  30.95 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0101  Acyl-homoserine-lactone synthase  31.41 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0183  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  34.91 
 
 		 175 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0180575  hitchhiker  0.000000220703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  33.12 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  29.76 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  28.72 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  30.14 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  27.37 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  32.04 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  31.1 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  26.98 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  31.98 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2029  autoinducer synthesis protein  34.59 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  30.61 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  28.8 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  28 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  29.37 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  31.76 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  30.77 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  33.79 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  31.08 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  25.93 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  24.5 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  25.5 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  24.5 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0919  autoinducer synthesis protein  28.57 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  28.99 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  28.4 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  29.5 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  29.5 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19130  autoinducer synthesis protein RhlI  24.29 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347386  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  29.5 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2851  autoinducer synthetase  26.63 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  25.15 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  32.95 
 
 		 182 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1650  autoinducer synthesis protein RhlI  23.44 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3897  autoinducer synthesis protein LasI  27.5 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.84 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45940  autoinducer synthesis protein LasI  27.5 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4280  autoinducer synthesis protein  30.05 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0241247  normal  0.0105559 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  30.5 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  30.5 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0415  putative autoinducer synthesis protein  29.09 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  27.85 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  25.86 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0787  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  27.33 
 
 		 196 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  31.87 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  25.5 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2668  autoinducer synthesis protein  26.9 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  26.28 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  29.67 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4583  autoinducer synthesis protein  28.21 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141788  hitchhiker  0.0000655879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4118  autoinducer synthesis protein  28.85 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000553872  hitchhiker  0.00840845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  23.65 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4726  autoinducer synthesis protein  28.21 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455128  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  25.3 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3641  autoinducer synthesis protein  28.21 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000011065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1050  autoinducer synthesis protein  28.21 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000000830053  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  25.68 
 
 		 183 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  22.97 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  25.68 
 
 		 183 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5574  autoinducer synthesis protein  28.21 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000539644  hitchhiker  0.00691296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2175  autoinducer synthesis protein  26.02 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.533935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  32.22 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3320  autoinducer synthesis protein  25.2 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2331  autoinducer synthesis protein  26.02 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.933975  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4152  autoinducer synthesis protein  22.99 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2998  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  24 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4466  autoinducer synthase  24.34 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>