62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0101 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0101  Acyl-homoserine-lactone synthase  100 
 
 		 212 aa  441  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4148  Acyl-homoserine-lactone synthase  63.21 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4429  Acyl-homoserine-lactone synthase  59.42 
 
 		 217 aa  274  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1656  autoinducer synthesis protein  55.71 
 
 		 214 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1546  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  55.71 
 
 		 214 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1716  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  55.24 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105822  hitchhiker  0.000229344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0067  autoinducer synthesis protein  55.73 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.719257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  51.18 
 
 		 216 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  51.18 
 
 		 216 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0183  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  50.59 
 
 		 175 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0180575  hitchhiker  0.000000220703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 		 226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  31.41 
 
 		 244 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  37.14 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  30.57 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  33.54 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  29.94 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  29.53 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  32.41 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  27.12 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  27.27 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  27.91 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  28.37 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  28.67 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  27.66 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  24.27 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  26.95 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2029  autoinducer synthesis protein  23.74 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  32.5 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  25.67 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  25.79 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  30.91 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  26.28 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  24.6 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  27.08 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  32.41 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  24.58 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  28.42 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  27.37 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  23.88 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0919  autoinducer synthesis protein  27.34 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  24.53 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3897  autoinducer synthesis protein LasI  31 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45940  autoinducer synthesis protein LasI  31 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  25.24 
 
 		 183 aa  45.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  25.24 
 
 		 183 aa  45.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  23.31 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  22.39 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0959  autoinducer synthesis protein  23.97 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  23.08 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  27.16 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6489  autoinducer synthesis protein  33.93 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191421  normal  0.837558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  29.79 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  23.08 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  23.08 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.72 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  24.49 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  29.13 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  23.08 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5461  autoinducer synthesis protein  21.8 
 
 		 201 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0626  autoinducer synthesis protein  24.79 
 
 		 210 aa  42  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  27.33 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>