25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0183 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  100 
 
 		 216 aa  364  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0183  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  100 
 
 		 175 aa  364  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0180575  hitchhiker  0.000000220703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  100 
 
 		 216 aa  364  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4148  Acyl-homoserine-lactone synthase  52.94 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4429  Acyl-homoserine-lactone synthase  49.13 
 
 		 217 aa  186  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0101  Acyl-homoserine-lactone synthase  50.59 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1716  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  46.51 
 
 		 218 aa  168  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105822  hitchhiker  0.000229344 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1546  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  46.51 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1656  autoinducer synthesis protein  46.51 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0067  autoinducer synthesis protein  42.94 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.719257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  36.53 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  34.91 
 
 		 244 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  31.69 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  32.77 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  32.64 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  31.91 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  27.52 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  30.5 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  24.67 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  25.68 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  27.56 
 
 		 222 aa  48.5  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  21.92 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  23.28 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2998  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  25.87 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  25.66 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>