108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0957 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  100 
 
 
193 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  42.94 
 
 
197 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.61 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  41.33 
 
 
203 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  36.88 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  36.88 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  35.23 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  35.23 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  40.41 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  36.69 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  35.19 
 
 
188 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  35.88 
 
 
212 aa  104  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  34.97 
 
 
206 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  33.55 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0804  N-acyl homoserine lactone synthase  33.91 
 
 
268 aa  99.4  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.648666  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  32.89 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0415  putative autoinducer synthesis protein  35.48 
 
 
249 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  34.55 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1577  N-acyl homoserine lactone synthase  32.04 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0618  N-acylhomoserine lactone synthase  32.02 
 
 
289 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0541466  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2022  autoinducer synthetase  32.04 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2216  autoinducer synthetase BpmI  32.02 
 
 
275 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0690156  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2129  autoinducer synthetase BpmI  32.04 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.466862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0700  autoinducer synthetase BpmI  32.04 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  33.16 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  35.86 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  35.17 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  35.86 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  35.86 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  32.26 
 
 
237 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  34.52 
 
 
207 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  35.62 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  35.62 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  35.62 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  35.86 
 
 
203 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  35.86 
 
 
203 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  35.86 
 
 
203 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  35.86 
 
 
203 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45940  autoinducer synthesis protein LasI  34.39 
 
 
201 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3897  autoinducer synthesis protein LasI  34.39 
 
 
201 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156305  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
212 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  31.43 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  38.35 
 
 
182 aa  92.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  31.58 
 
 
214 aa  91.3  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1650  autoinducer synthesis protein RhlI  38.36 
 
 
202 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19130  autoinducer synthesis protein RhlI  36.97 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347386  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  34.25 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  31.98 
 
 
204 aa  88.2  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  31.01 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4583  autoinducer synthesis protein  36.36 
 
 
202 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141788  hitchhiker  0.0000655879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4118  autoinducer synthesis protein  36.36 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000553872  hitchhiker  0.00840845 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  31.88 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  31.88 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  30.46 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  29.79 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1050  autoinducer synthesis protein  33.8 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000000830053  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3641  autoinducer synthesis protein  33.8 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000011065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4726  autoinducer synthesis protein  33.8 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455128  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5574  autoinducer synthesis protein  33.8 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000539644  hitchhiker  0.00691296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5028  autoinducer synthesis protein  33.56 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.548856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  31.91 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4280  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0241247  normal  0.0105559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4513  autoinducer synthesis protein  32.88 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4976  autoinducer synthesis protein  32.88 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  29.69 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  26.98 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6489  autoinducer synthesis protein  36 
 
 
119 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191421  normal  0.837558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  28.09 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  27.38 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  28.87 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  29.73 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  26.75 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  29.76 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2668  autoinducer synthesis protein  28.14 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637117  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5461  autoinducer synthesis protein  28.57 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  26.84 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  26.84 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  26.03 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  23.03 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  29.32 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2312  autoinducer synthesis protein  27.42 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.362295  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5763  autoinducer synthesis protein  28.45 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124199  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0919  autoinducer synthesis protein  22.96 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.142092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  28.06 
 
 
227 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  29.93 
 
 
218 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  29.37 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4429  Acyl-homoserine-lactone synthase  29.41 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2029  autoinducer synthesis protein  25.71 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  24.03 
 
 
222 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0626  autoinducer synthesis protein  27.27 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196351  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  27.69 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2851  autoinducer synthetase  28.85 
 
 
206 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3111  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  26.71 
 
 
249 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4466  autoinducer synthase  21.91 
 
 
207 aa  48.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4148  Acyl-homoserine-lactone synthase  27.94 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6377  putative autoinducer synthesis protein  29.59 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6407  putative autoinducer synthesis protein  29.59 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0067  autoinducer synthesis protein  32.22 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.719257  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1716  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  28.19 
 
 
218 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105822  hitchhiker  0.000229344 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1546  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  28.38 
 
 
214 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>