38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2998 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2998  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  100 
 
 		 225 aa  476  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3111  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  29.32 
 
 		 249 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  26.35 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  25.43 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  25.43 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0067  autoinducer synthesis protein  26.8 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.719257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  23.08 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0626  autoinducer synthesis protein  23.67 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  26.14 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  23.97 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4148  Acyl-homoserine-lactone synthase  26.62 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  23.08 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  27.75 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.73 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  32.99 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3641  autoinducer synthesis protein  24.71 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000011065  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4583  autoinducer synthesis protein  24.71 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141788  hitchhiker  0.0000655879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4118  autoinducer synthesis protein  24.71 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000553872  hitchhiker  0.00840845 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4726  autoinducer synthesis protein  24.71 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455128  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1050  autoinducer synthesis protein  24.71 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000000830053  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5574  autoinducer synthesis protein  24.71 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000539644  hitchhiker  0.00691296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  27.19 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  30.23 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  22.99 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3897  autoinducer synthesis protein LasI  30.3 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45940  autoinducer synthesis protein LasI  30.3 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  28.17 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  26.06 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  28.17 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0183  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  25.87 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0180575  hitchhiker  0.000000220703 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  27.46 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  21.69 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  24 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4429  Acyl-homoserine-lactone synthase  23.46 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  21.69 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2312  autoinducer synthesis protein  22 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.362295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  22.6 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  21.08 
 
 		 210 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>