58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3111 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3111  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  100 
 
 		 249 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2998  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  29.32 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  29.47 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  32.76 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  28.66 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  28.05 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  30.11 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  30.67 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  29.53 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  28.95 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  26.32 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  26.91 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2331  autoinducer synthesis protein  28.65 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.933975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2175  autoinducer synthesis protein  28.65 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.533935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  28.29 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0626  autoinducer synthesis protein  25.28 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0959  autoinducer synthesis protein  23.83 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  26.45 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  26.63 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  25.45 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.96 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  27.12 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  24.62 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  25.97 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  26.71 
 
 		 193 aa  48.9  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  27.03 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3320  autoinducer synthesis protein  28.07 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4513  autoinducer synthesis protein  25.28 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  26.63 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4976  autoinducer synthesis protein  25.28 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5461  autoinducer synthesis protein  28.72 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5028  autoinducer synthesis protein  24.72 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548856 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  26.04 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  25.15 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  24.85 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  26.46 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  29.03 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  22.84 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  29.2 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  28.3 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  22.07 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  23.57 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  23.57 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  28.3 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  28.3 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  23.26 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2312  autoinducer synthesis protein  26.82 
 
 		 200 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.362295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  25 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  27.74 
 
 		 201 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  24.46 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  30.65 
 
 		 251 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  25 
 
 		 216 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  25 
 
 		 216 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  27.36 
 
 		 203 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  27.36 
 
 		 203 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  27.36 
 
 		 203 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  27.36 
 
 		 203 aa  42  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  22.3 
 
 		 250 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>