107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1293 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  99.51 
 
 
203 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  99.51 
 
 
203 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  99.51 
 
 
203 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  99.51 
 
 
203 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  97.04 
 
 
203 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1050  autoinducer synthesis protein  76.85 
 
 
202 aa  316  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000000830053  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3641  autoinducer synthesis protein  78.76 
 
 
202 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000011065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4726  autoinducer synthesis protein  78.76 
 
 
202 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455128  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5574  autoinducer synthesis protein  78.76 
 
 
202 aa  314  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000539644  hitchhiker  0.00691296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4118  autoinducer synthesis protein  76.85 
 
 
213 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000553872  hitchhiker  0.00840845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4583  autoinducer synthesis protein  76.85 
 
 
202 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141788  hitchhiker  0.0000655879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  70.44 
 
 
213 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  66.67 
 
 
204 aa  255  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  49.22 
 
 
206 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  49.22 
 
 
206 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  49.22 
 
 
206 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  50 
 
 
201 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  53.71 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  53.71 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  46.11 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  47.67 
 
 
206 aa  168  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  47.43 
 
 
220 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  48.11 
 
 
188 aa  153  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  40.96 
 
 
237 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1650  autoinducer synthesis protein RhlI  44.64 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  41.36 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19130  autoinducer synthesis protein RhlI  43.45 
 
 
201 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347386  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0804  N-acyl homoserine lactone synthase  43.65 
 
 
268 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.648666  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0415  putative autoinducer synthesis protein  37.84 
 
 
249 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1577  N-acyl homoserine lactone synthase  41.88 
 
 
202 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2022  autoinducer synthetase  41.88 
 
 
202 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0700  autoinducer synthetase BpmI  41.88 
 
 
202 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2216  autoinducer synthetase BpmI  42.02 
 
 
275 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0690156  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0618  N-acylhomoserine lactone synthase  42.02 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0541466  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2129  autoinducer synthetase BpmI  42.02 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.466862  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  43.2 
 
 
182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4280  autoinducer synthesis protein  42.38 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0241247  normal  0.0105559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.75 
 
 
191 aa  99  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  35.86 
 
 
193 aa  95.9  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  33.15 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  34.57 
 
 
195 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  30.16 
 
 
197 aa  91.3  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  35.33 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  32.9 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  32.24 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  33.68 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  32.45 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  34.73 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  34.84 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  32.39 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  32.78 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  34.25 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  32.72 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0959  autoinducer synthesis protein  30.48 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0369652  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  31.36 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  33.53 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  29.7 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45940  autoinducer synthesis protein LasI  32.4 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3897  autoinducer synthesis protein LasI  32.4 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  32.54 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  33.14 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  28.49 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5763  autoinducer synthesis protein  31.38 
 
 
207 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124199  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6377  putative autoinducer synthesis protein  34.91 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6407  putative autoinducer synthesis protein  34.91 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4513  autoinducer synthesis protein  29.76 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  33.58 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5028  autoinducer synthesis protein  29.57 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.548856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4976  autoinducer synthesis protein  29.76 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  30.54 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  31.41 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0626  autoinducer synthesis protein  27.87 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196351  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2312  autoinducer synthesis protein  29.65 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.362295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5461  autoinducer synthesis protein  30.77 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  29.21 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0919  autoinducer synthesis protein  26 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.142092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2851  autoinducer synthetase  33.33 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  33.53 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  32.72 
 
 
218 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  28.41 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  26.92 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  34.57 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  31.29 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3320  autoinducer synthesis protein  29.07 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2175  autoinducer synthesis protein  30.43 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.533935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2331  autoinducer synthesis protein  30.43 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.933975  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2668  autoinducer synthesis protein  31.9 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637117  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6489  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
119 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191421  normal  0.837558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2029  autoinducer synthesis protein  31.79 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4466  autoinducer synthase  39.08 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  29.33 
 
 
226 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4152  autoinducer synthesis protein  26.67 
 
 
211 aa  54.7  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0312  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  29.41 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.434992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4020  autoinducer synthesis protein  37.84 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.111702 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0787  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  26.04 
 
 
196 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421704  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1546  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  23.81 
 
 
214 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>