30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0365 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  553  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  54.1 
 
 
246 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  31.43 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  35.19 
 
 
269 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  33.47 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  33.61 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  32.24 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  29.88 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  31.05 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  32.16 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  32.68 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  30.2 
 
 
249 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  28.37 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  31.25 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  30.2 
 
 
241 aa  92.4  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  28.45 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  24.02 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  22.52 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  28.64 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  26.6 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  26.47 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  25.46 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3111  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  25.97 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4513  autoinducer synthesis protein  30.16 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4976  autoinducer synthesis protein  30.16 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  23.62 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  25.14 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  32.39 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5028  autoinducer synthesis protein  29.37 
 
 
211 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.548856 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  33.96 
 
 
212 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>