33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01886 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  100 
 
 		 298 aa  617  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  38.2 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  36.95 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  30.86 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  31.69 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  29.66 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  31.2 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  27.43 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  31.31 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  27.63 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  30.74 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  30.6 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  30.13 
 
 		 249 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  28.37 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  31.19 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  28.1 
 
 		 254 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  28.7 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  27.14 
 
 		 233 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  25.12 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  23.35 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  24.2 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  25.4 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0395  hypothetical protein  29.91 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2504  hypothetical protein  22.37 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.745872 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  27.43 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  30.95 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  31.94 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3111  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  22.07 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  29.7 
 
 		 338 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  28.83 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  30.56 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  30.56 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  30.56 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>