33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4396 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  574  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  52.79 
 
 		 269 aa  308  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  52.42 
 
 		 287 aa  285  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  38.68 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  38.96 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  39.41 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  31.43 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  33.2 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  30.86 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  31.92 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  32.05 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  30.9 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  31.63 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  29.67 
 
 		 311 aa  95.1  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  31.98 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  30.52 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  28.25 
 
 		 233 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  30.32 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  26.64 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  26.92 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  25.13 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  32.52 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  21.98 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3111  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  26.63 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  22.47 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.37 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  24.62 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  24.62 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  21.43 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2312  autoinducer synthesis protein  27.62 
 
 		 200 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.362295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2331  autoinducer synthesis protein  37.25 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.933975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2175  autoinducer synthesis protein  37.25 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.533935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>