24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1148 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  42.68 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  36.67 
 
 
249 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  38.68 
 
 
244 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  35.12 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  36.07 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  29.88 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  34.03 
 
 
246 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  30.9 
 
 
274 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  31.9 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  35.24 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  34.11 
 
 
287 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  34.93 
 
 
251 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  31.65 
 
 
241 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  32.23 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  31.51 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  28.1 
 
 
298 aa  92  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  28.51 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  40.5 
 
 
157 aa  79  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  30.8 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  26.73 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  24.12 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  29.23 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>