26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1995 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  521  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  47.93 
 
 
244 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  37.3 
 
 
270 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  36.67 
 
 
254 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  39.33 
 
 
260 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  39.48 
 
 
311 aa  158  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  38.16 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  122  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  32.38 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  32.05 
 
 
274 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  32.65 
 
 
256 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  34.88 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  33.47 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  31.22 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  28.76 
 
 
233 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  30.2 
 
 
273 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  30.13 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  37.91 
 
 
157 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  28 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  24.46 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  27.55 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2504  hypothetical protein  26.98 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.745872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  25.24 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  26.44 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  36.21 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000906572  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  28.95 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>