26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0149 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  529  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2504  hypothetical protein  43.46 
 
 
267 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.745872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  31.12 
 
 
244 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  26.6 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  28.76 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  21.86 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  24.62 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  26.7 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  26.51 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  29.38 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  24.64 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  27.78 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  25.13 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  24.2 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  26.73 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  26.44 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  34.35 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  25.71 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  26.24 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  36.26 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3111  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  22.84 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.23 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  28.36 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  26.72 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  27.61 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  26.92 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>