22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2504 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2504  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  534  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.745872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  43.46 
 
 
264 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  36.73 
 
 
244 aa  119  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  30.53 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  26.98 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  29.13 
 
 
246 aa  62.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  30.56 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  27.5 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  35.11 
 
 
233 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  22.61 
 
 
272 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  25.84 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  29.27 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  27.95 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  25.94 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  23.33 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  27.62 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  22.37 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  22.27 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  27.62 
 
 
282 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  27.69 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  28.29 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  25.48 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>