30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2037 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  37.3 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  36.97 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  33.85 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  35.12 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  34.48 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  30.74 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  32.27 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  27.73 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  29.2 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  28.05 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  30.52 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  29.44 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  30.92 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  30.05 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  24.02 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  28.77 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  24.24 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  21.86 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  30.56 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  22.17 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0395  hypothetical protein  30.17 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2504  hypothetical protein  23.33 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.745872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3111  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  24.62 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  27.64 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  27.56 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2719  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.15 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1892  putative hemolysin  27.83 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185839  normal  0.463503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>