28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1204 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  52.79 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  59.75 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  38.2 
 
 		 298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  38.91 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  40 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  35.19 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  37 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  37.21 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  34.83 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  33.76 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  38.16 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  31.9 
 
 		 254 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  35.6 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  30.32 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  32.27 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  30.26 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  29.91 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  29.22 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  27.9 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  24.64 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  31.01 
 
 		 157 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3111  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  27.03 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.33 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  28.97 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  38.71 
 
 		 218 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  38.71 
 
 		 218 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>