25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2503 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  533  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  49.79 
 
 
251 aa  235  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  37.26 
 
 
282 aa  152  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  34.83 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  39.38 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  36.07 
 
 
256 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  38.35 
 
 
272 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  32.38 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  35.22 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  32.16 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  35.24 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  32.11 
 
 
246 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  27.63 
 
 
298 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  32.23 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  28.05 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  28.57 
 
 
311 aa  89  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  29.38 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  31.63 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  31.37 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2504  hypothetical protein  27.5 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.745872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  41.86 
 
 
157 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  24.89 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  26.24 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2998  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  30.23 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.897575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>