34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1524 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  586  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  43.58 
 
 
251 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  37.26 
 
 
258 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  37 
 
 
269 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  31.92 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  122  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  33.07 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  36.32 
 
 
244 aa  118  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  31.2 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  34.25 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  27.73 
 
 
270 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  29.76 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  31.25 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  31.51 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  31.28 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  27.44 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  28.5 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  28.87 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  26.56 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  30.52 
 
 
244 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  35.78 
 
 
157 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  34.35 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  30.4 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  25.14 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2504  hypothetical protein  27.62 
 
 
267 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.745872 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  25.87 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  39.71 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  30.25 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  30.25 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  30.25 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.51 
 
 
249 aa  42.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  28.47 
 
 
271 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  25.31 
 
 
206 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>