26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1996 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  39.48 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  33.85 
 
 		 270 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  35.12 
 
 		 244 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  36.07 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  29.8 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  29.61 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  29.67 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  31.19 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  92.8  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  30.52 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  29.15 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  26.85 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  28.75 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  29.47 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  27.44 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2504  hypothetical protein  30.53 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.745872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  29.09 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  22.52 
 
 		 273 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  27.8 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  29.38 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  28.35 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  37.78 
 
 		 157 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  26.51 
 
 		 197 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  26.51 
 
 		 197 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>