50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01314 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  59.75 
 
 		 269 aa  309  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  52.42 
 
 		 274 aa  295  7e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  36.95 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  39.75 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  37.21 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  39.35 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  35.43 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  39.38 
 
 		 258 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  32.77 
 
 		 273 aa  132  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  32.81 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  31.22 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  36.65 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  34.48 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  34.11 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  35 
 
 		 241 aa  93.6  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  29.47 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  28.96 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  30.05 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  30.69 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0149  hypothetical protein  27.91 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  26.78 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  29.37 
 
 		 157 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.57 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  29.25 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  29.25 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  28.57 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  27.89 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  27.89 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  27.63 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  27.89 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  27.89 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  27.89 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  27.89 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  27.89 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  27.89 
 
 		 338 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  28.66 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  28.66 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  27.89 
 
 		 268 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  27.89 
 
 		 268 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  27.03 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4066  hypothetical protein  30.61 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311734  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  29.11 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.13 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.35 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  25.68 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  30.36 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  27.27 
 
 		 255 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  24.32 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>