23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0525 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0525  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0524  hypothetical protein  83.95 
 
 		 256 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01314  hypothetical protein  37.21 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4396  hypothetical protein  38.96 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1204  hypothetical protein  40 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0150  hypothetical protein  38.86 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1620  hypothetical protein  34.93 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0365  hypothetical protein  33.61 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.637133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2503  hypothetical protein  38.35 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.960499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01886  Uvs051  29.66 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1995  hypothetical protein  33.47 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1524  hypothetical protein  34.25 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.377988  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.384851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1327  hypothetical protein  30.7 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2037  hypothetical protein  30.05 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173054  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1954  hypothetical protein  30.08 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1996  hypothetical protein  27.8 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3220  hypothetical protein  29.72 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1523  hypothetical protein  26.92 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3217  hypothetical protein  26.46 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2504  hypothetical protein  22.61 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.745872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1334  hypothetical protein  31.08 
 
 		 157 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.205283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2038  hypothetical protein  21.61 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0958338  normal  0.0449216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>